Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms