Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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RNF183Q96D59 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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RNF183Q96D59 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RNF183Q96D59 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RNF183Q96D59 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RNF183Q96D59 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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RNF183Q96D59 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF183Q96D59 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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