Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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