Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKL1Q969V6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms