Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF34Q969K3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RNF34Q969K3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RNF34Q969K3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RNF34Q969K3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RNF34Q969K3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms