Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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GTF3C6Q969F1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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