Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms