Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms