Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms