Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL11Q8NHH1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms