Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms