Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDDC3Q8N4P3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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