Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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