Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms