Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD4Q7Z3J3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD4Q7Z3J3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms