Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF550Q7Z398 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms