Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms