Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms