Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms