Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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