Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms