Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms