Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms