Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP3Q6NUK4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms