Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms