Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL1Q5VZK9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms