Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP6Q5VW22 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms