Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms