Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms