Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms