Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms