Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms