Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KHDC3LQ587J8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms