Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms