Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms