Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TPRNQ4KMQ1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPRNQ4KMQ1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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