Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms