Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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