Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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