Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FXNQ16595 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FXNQ16595 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FXNQ16595 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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