Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms