Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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