Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF56Q15929 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms