Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USF2Q15853 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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