Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms