Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EEA1Q15075 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EEA1Q15075 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EEA1Q15075 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EEA1Q15075 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EEA1Q15075 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EEA1Q15075 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EEA1Q15075 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms