Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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BRD3Q15059 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRD3Q15059 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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BRD3Q15059 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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