Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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