Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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