Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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